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Summary

Details

Page properties
Content
... ... @@ -1,4 +1,4 @@
1 -= Reporting lab results to TerraIndex for a customer =
1 += Exporting lab results to TerraIndex for a customer =
2 2  
3 3  Returning the labresults to the client, that requested the analysis on samples.
4 4  
... ... @@ -14,11 +14,11 @@
14 14  A lab result file is an XML file contains all the lab results. The results are mapped tot their analyses samples. A lab result will be matched to the corresponding analyses sample based on the: “Labassignment Guid/SIKB-ID, projectCode, AnalysisSample Guid/SIKB-ID”
15 15  
16 16  
17 -**Example files**: [[attach:labresult_IndividualGw.xml||rel="noopener noreferrer" target="_blank"]], [[attach:labresult_IndividualGr.xml||rel="noopener noreferrer" target="_blank"]], [[attach:labresult_MixedSampleGr.xml||rel="noopener noreferrer" target="_blank"]]
17 +**Example files**: [[attach:labresultaat_MengmonsterGr.xml||rel="noopener noreferrer" target="_blank"]], [[attach:labresultaat_IndividueelGr.xml||rel="noopener noreferrer" target="_blank"]], [[attach:labresultaat_IndividueelGw.xml||rel="noopener noreferrer" target="_blank"]]
18 18  
19 19  **XSD**: Ask or SIKB Members can download from: [[https:~~/~~/www.sikb.nl/datastandaarden/richtlijnen/sikb0101>>url:https://www.sikb.nl/datastandaarden/richtlijnen/sikb0101]]
20 20  
21 -**Controle XSLT**: [[attach:Labresult_Controle.xsl||rel="noopener noreferrer" target="_blank"]]
21 +**Controle XSLT**: [[attach:Labresult_Controle.xsl||rel=" noopener noreferrer" target="_blank"]]
22 22  
23 23  **Domaintable files**: [[immetingen lookup v14.8.0.xml>>url:https://wiki.terraindex.com/bin/download/Implementation%20documentation/Setting%20up%20Lab%20communication%20by%20REST%20services%20with%20TerraIndex/Lab%20assignment%20file/WebHome/immetingen%20lookup%20v14.8.0.xml?rev=1.2]]   [[imsikb0101 lookup v14.8.0.xml>>url:https://wiki.terraindex.com/bin/download/Implementation%20documentation/Setting%20up%20Lab%20communication%20by%20REST%20services%20with%20TerraIndex/Lab%20assignment%20file/WebHome/imsikb0101%20lookup%20v14.8.0.xml?rev=1.1]]
24 24  extracted from: **[[https:~~/~~/codes.sikb.nl>>url:https://codes.sikb.nl/]] **
... ... @@ -46,38 +46,18 @@
46 46  |(% colspan="1" rowspan="1" %)**supplier**|(% colspan="1" rowspan="1" %)The number you get from TerraIndex. This needs to be the same as the laboratorium number in the lab delivery file. Your supplier code can be requested of found here: [[https:~~/~~/codes.sikb.nl/tablet/domain-table-details/dc2ad4df-f958-4146-aee8-31f8c2f1c74b>>https://codes.sikb.nl/tablet/domain-table-details/dc2ad4df-f958-4146-aee8-31f8c2f1c74b]]|(% colspan="1" rowspan="1" %)string
47 47  |(% colspan="1" rowspan="1" %)**dataflow**|(% colspan="1" rowspan="1" %)Should be '1' in this case, what stands voor 'AnalysisResults'. Other option can be found here: [[https:~~/~~/codes.sikb.nl/tablet/domain-table-details/79365ded-f56a-4f10-ba45-16bac69752d9>>https://codes.sikb.nl/tablet/domain-table-details/79365ded-f56a-4f10-ba45-16bac69752d9]]|(% colspan="1" rowspan="1" %)integer
48 48  
49 -=== Labassignment ===
49 +===
50 +Labassignment ===
50 50  
51 51  The labassignment is the same as in the labassignment file: [[Lab assignment file - SIKB0101 v14>>https://wiki.terraindex.com/bin/view/Implementation%20documentation/Setting%20up%20Lab%20communication%20by%20REST%20services%20with%20TerraIndex/Lab%20assignment%20file/#]]
52 52  
53 -With 3 differences/additions:
54 +With 3 differences:
54 54  
55 55  * Status on the labassignment itself
56 56  * Status on the labassignment.sample link
57 57  * The labassignment Report number can be send in: LabAssignmentCertificate
58 58  
59 -|**Attribute**|**Notes**
60 -|(((
61 -**identification** NEN3610ID
62 -)))|(((
63 -A unique code that is created when the object is created for the first time.
64 -)))
65 -|(((
66 -**operatingLab** GenericName
67 67  
68 -
69 -)))|(((
70 -Code of the laboratory to which the assignment is assigned.
71 -
72 -Domaintable: [[Meetinstantie / Measuring Company>>url:https://codes.sikb.nl/tablet/domain-table-details/4e270f0a-cefe-446e-9d4d-6666c91180a8]]
73 -)))
74 -|(((
75 -**startTime** DateTime
76 -)))|Dispatch date of the lab assignment
77 -|(((
78 -**customerCode** CharacterString
79 -)))|Client code or debtor number of the client as known by the laboratory
80 -
81 81  === LabAssignmentStatus ===
82 82  
83 83  |**Attribute Name**|**Description**
... ... @@ -113,7 +113,7 @@
113 113  Domain table: [[Certification Coding>>https://codes.sikb.nl/tablet/domain-table-details/df7ffd7c-192c-44f7-ae9f-0461d9266b30]]
114 114  )))
115 115  
116 -=== LabAssignmentRequest ===
96 +== LabAssignmentRequest ==
117 117  
118 118  The connection between the labassignment and the samples with analysisrequests, as send in the labassignment.
119 119  
... ... @@ -121,7 +121,7 @@
121 121  Just fill what you can fill, otherwise leave field empty, based on documentation here: [[Labassignment file - SIKB0101 v14>>https://wiki.terraindex.com/bin/view/Implementation%20documentation/Setting%20up%20Lab%20communication%20by%20REST%20services%20with%20TerraIndex/Lab%20assignment%20file/#]]
122 122  
123 123  
124 -=== Project ===
104 +== Project ==
125 125  
126 126  Activity that leads to the collection of soil data, as send in the labassignment.
127 127  It will be used to search the correct project/investiation to bind or create the samples.
... ... @@ -139,8 +139,9 @@
139 139  **projectCode** CharacterString
140 140  )))|The project code of the project where the lab results are for, as send in the labassignment
141 141  
142 -=== Sample (AnalysisSample) ===
143 143  
123 +== Sample (AnalysisSample) ==
124 +
144 144  The analysissamples with analysisrequests, as send in the labassignment. The fieldsamples form the labassignment can be skipped in the results file.
145 145  
146 146  If not retreived in a labassignment, make it yourself so we can import is as new analysissamples.
... ... @@ -154,7 +154,7 @@
154 154  |**Attribute**|**Notes**
155 155  |(((
156 156  **identification** NEN3610ID
157 -)))|The unique identifier of TerraIndex for the analyses sample, to keep this value unique forever in the whole exchange chain.
138 +)))|The unique identifier of TerraIndex for the analyses sample
158 158  |(((
159 159  **name** CharacterString
160 160  
... ... @@ -181,29 +181,25 @@
181 181  Domaintable: [[Compartiment / Matrix>>url:https://codes.sikb.nl/tablet/domain-table-details/6134f3bb-6048-431d-a130-01290d84172c]]
182 182  )))
183 183  
184 -=== Analysis ===
185 185  
186 -The measured parameter with it's value and process.
166 +== Analysis ==
187 187  
188 188  |**Attribute Name**|**Description**
189 189  |(((
190 190  **identification** NEN3610ID
191 -)))|The unique identifier of the AnalysisResult, to keep this value unique forever in the whole exchange chain.
192 -If not possible to store this in the Lims, generate on the fly.
193 -(% class="info" %)|(((
171 +)))|The unique identifier of the Project in TerraIndex and in the whole Exchange Chain, as send in the labassignment
172 +|(((
194 194  **physicalProperty **PhysicalProperty
195 195  )))|(((
196 196  The combination of Quantity, Parameter and Condition to provide the parameter that has been measured.
197 -**[[See this chapter for the combinations, and the CAS-NR's. >>https://wiki.terraindex.com/bin/view/Implementation%20documentation/Setting%20up%20Lab%20communication%20by%20REST%20services%20with%20TerraIndex/Lab%20result%20file/#HSIKB14Parameterresultcombinations]]**
176 +See this chapter for the combinations, and the CAS-NR's.
198 198  
199 199  
200 200  )))
201 -|**result **AnalyticResult|The result of the analysis, see next chapter.
202 -|**procedure **AnalysisProcess|The process that has been used to measure/determine the result, see next chapter.
180 +| |
203 203  
204 204  === AnalyticResult (inherited from MeasureResult) ===
205 205  
206 -The actual reported value, result of detection limit.
207 207  
208 208  |**Attribute Name**|**Description**
209 209  |(((
... ... @@ -254,32 +254,12 @@
254 254  **alphanumericValue** CharacterString
255 255  )))|Textual value associated with an analysis result
256 256  
257 -=== AnalysisProcess ===
234 +==== ====
258 258  
259 -The process that has been used to detemine the measured value or result.
236 +==== ====
260 260  
261 -|**Attribute Name**|**Description**
262 -|(((
263 -**identification** NEN3610ID
264 -)))|The unique identifier of the AnalysisProcess, it can be bound to multiple results at once.
265 -|**analyticalTechnique **GenericName|(((
266 -The used analytical technique to detemine the result.
238 += What to exchange to bind the right results to the right sample? =
267 267  
268 -Domain table: [[AnalyticalTechnique>>https://codes.sikb.nl/tablet/domain-table-details/04be2365-3d05-4903-a53e-edafef7111e8]]
269 -)))
270 -|**certification **GenericName|(((
271 -The used certification to detemine the result.
272 -
273 -Domain table: [[CertificationCode>>https://codes.sikb.nl/tablet/domain-table-details/04be2365-3d05-4903-a53e-edafef7111e8]]
274 -)))
275 -|**valuationMethod **GenericName|(((
276 -The used valuation method to detemine the result.
277 -
278 -Domain table: [[ValuationMethod>>https://codes.sikb.nl/tablet/domain-table-details/04be2365-3d05-4903-a53e-edafef7111e8]]
279 -)))
280 -
281 -= What to exchange to bind the results to the correct sample? =
282 -
283 283  The data stream ‘Lab Result’ is the feedback of analysis results on the requested lab assignment at a laboratory. At import we need to bind it onto the correct sample.
284 284  
285 285  This requires importand field to match the samples in the xml to the samples in our database.
... ... @@ -317,6 +317,7 @@
317 317  * If Project is found, but the analysis sample is not; then this analysis sample is imported as a new analysis sample with all results.
318 318  * (If it concerns water samples, a new fictional/temporary measuring point and filter could be created.)
319 319  
277 +
320 320  = SIKB 14 Parameter result combinations =
321 321  
322 322  In the SIKB0101 version 14 exchange of **__labresults is combination needed __**for exchanging the result parameters of the Lab analysis.
labresult_IndividualGr.xml
Author
... ... @@ -1,1 +1,0 @@
1 -XWiki.RobinHuisman
Size
... ... @@ -1,1 +1,0 @@
1 -15.3 KB
Content
... ... @@ -1,283 +1,0 @@
1 -<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
2 -<imsikb0101:FeatureCollectionIMSIKB0101 gml:id="LABRESULTAAT" xmlns:imsikb0101="http://www.sikb.nl/imsikb0101" xmlns:immetingen="http://www.sikb.nl/immetingen" xmlns:gco="http://www.isotc211.org/2005/gco" xmlns:gmd="http://www.isotc211.org/2005/gmd" xmlns:gsr="http://www.isotc211.org/2005/gsr" xmlns:gss="http://www.isotc211.org/2005/gss" xmlns:gts="http://www.isotc211.org/2005/gts" xmlns:gml="http://www.opengis.net/gml/3.2" xmlns:om="http://www.opengis.net/om/2.0" xmlns:sam="http://www.opengis.net/sampling/2.0" xmlns:sams="http://www.opengis.net/samplingSpatial/2.0" xmlns:spec="http://www.opengis.net/samplingSpecimen/2.0" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:schemaLocation="http://www.sikb.nl/imsikb0101 file:///C:/dev/SIKB0101_Protocol/XSDs%2014.8.0/imsikb0101_v14.8.0.xsd">
3 - <imsikb0101:metaData>
4 - <imsikb0101:application>urn:imsikb0101:Applicaties:id:1</imsikb0101:application>
5 - <imsikb0101:date>2013-09-07</imsikb0101:date>
6 - <imsikb0101:organisation>The Organization</imsikb0101:organisation>
7 - <imsikb0101:remarks>Example File LABRESULT</imsikb0101:remarks>
8 - <imsikb0101:reportDate>2013-07-07</imsikb0101:reportDate>
9 - <imsikb0101:sender>urn:imsikb0101:Bronhouders:id:54</imsikb0101:sender>
10 - <imsikb0101:supplier>urn:imsikb0101:Leveranciers:id:1</imsikb0101:supplier>
11 - <imsikb0101:version>14.8.0</imsikb0101:version>
12 - <imsikb0101:dataflow>urn:imsikb0101:DatastroomType:id:1</imsikb0101:dataflow>
13 - </imsikb0101:metaData>
14 - <!-- LabAssignment -->
15 - <imsikb0101:featureMember>
16 - <imsikb0101:LabAssignment gml:id="_ac5e3b6d-a0b2-4e26-af89-a2778712ff89">
17 - <imsikb0101:identification>
18 - <immetingen:NEN3610ID>
19 - <immetingen:namespace>www.sikb.nl</immetingen:namespace>
20 - <immetingen:lokaalID>ac5e3b6d-a0b2-4e26-af89-a2778712ff89</immetingen:lokaalID>
21 - </immetingen:NEN3610ID>
22 - </imsikb0101:identification>
23 - <imsikb0101:operatingLab>urn:immetingen:Meetinstantie:id:7</imsikb0101:operatingLab>
24 - <imsikb0101:startTime>2013-04-09T18:22:55</imsikb0101:startTime>
25 - <imsikb0101:customerCode>KN1234</imsikb0101:customerCode>
26 - <imsikb0101:remarks>Remarks about the LabAssignment</imsikb0101:remarks>
27 - <imsikb0101:endTime>2013-04-09T18:22:55</imsikb0101:endTime>
28 - <imsikb0101:belongsToProject xlink:href="#_015c6207-2bed-4f3b-bb40-8ab94079bff5"/>
29 - <imsikb0101:analysisRequest>
30 - <imsikb0101:SampleAnalysisRequest>
31 - <imsikb0101:nameOnLabCertificate>BO01-DM1 (10-50)</imsikb0101:nameOnLabCertificate>
32 - <imsikb0101:certificateOrder>0</imsikb0101:certificateOrder>
33 - <imsikb0101:labSampleType>12</imsikb0101:labSampleType>
34 - <imsikb0101:sampleCertification>urn:immeringen:CertificeringsCode:id:8</imsikb0101:sampleCertification>
35 - <imsikb0101:sample xlink:href="#_b1adf8f7-e0cd-4810-a93e-60580f34b3fa"/>
36 - <imsikb0101:status>
37 - <imsikb0101:LabAssignmentStatus>
38 - <imsikb0101:statusType>urn:immetingen:LabopdrachtStatus:id:5</imsikb0101:statusType>
39 - <imsikb0101:dateExpected>2013-07-28</imsikb0101:dateExpected>
40 - <imsikb0101:remarks>Remarks about the status</imsikb0101:remarks>
41 - </imsikb0101:LabAssignmentStatus>
42 - </imsikb0101:status>
43 - </imsikb0101:SampleAnalysisRequest>
44 - </imsikb0101:analysisRequest>
45 - <imsikb0101:projectLeader xlink:href="#_808ef96a-1323-45f8-bab1-afde379884d5"/>
46 - <imsikb0101:status>
47 - <imsikb0101:LabAssignmentStatus>
48 - <imsikb0101:statusType>urn:immetingen:LabopdrachtStatus:id:6</imsikb0101:statusType>
49 - <imsikb0101:dateExpected>2013-07-28</imsikb0101:dateExpected>
50 - <imsikb0101:remarks>Remarks about the status</imsikb0101:remarks>
51 - </imsikb0101:LabAssignmentStatus>
52 - </imsikb0101:status>
53 - <imsikb0101:certificate>
54 - <imsikb0101:LabAssignmentCertificate>
55 - <imsikb0101:complementOfCertificate>CERT21341</imsikb0101:complementOfCertificate>
56 - <imsikb0101:labCertificateNumber>CERT21342</imsikb0101:labCertificateNumber>
57 - <imsikb0101:certification>urn:immetingen:Certificeringscode:id:4</imsikb0101:certification>
58 - <imsikb0101:labCertificatePdfLink>https://www.example.com/cert/link.pdf</imsikb0101:labCertificatePdfLink>
59 - </imsikb0101:LabAssignmentCertificate>
60 - </imsikb0101:certificate>
61 - </imsikb0101:LabAssignment>
62 - </imsikb0101:featureMember>
63 - <!-- /LabAssignment -->
64 - <!-- Project -->
65 - <imsikb0101:featureMember>
66 - <imsikb0101:Project gml:id="_015c6207-2bed-4f3b-bb40-8ab94079bff5">
67 - <imsikb0101:identification>
68 - <immetingen:NEN3610ID>
69 - <immetingen:namespace>SIKB</immetingen:namespace>
70 - <immetingen:lokaalID>015c6207-2bed-4f3b-bb40-8ab94079bff5</immetingen:lokaalID>
71 - </immetingen:NEN3610ID>
72 - </imsikb0101:identification>
73 - <imsikb0101:name>Name of the project</imsikb0101:name>
74 - <imsikb0101:projectCode>PROJ00238</imsikb0101:projectCode>
75 - </imsikb0101:Project>
76 - </imsikb0101:featureMember>
77 - <!-- /Project -->
78 - <!-- Subject 1-->
79 - <imsikb0101:featureMember>
80 - <immetingen:Person gml:id="_808ef96a-1323-45f8-bab1-afde379884d5">
81 - <immetingen:email>username@example.com</immetingen:email>
82 - <immetingen:fax>+31(0) 88 666222</immetingen:fax>
83 - <immetingen:identification>
84 - <immetingen:NEN3610ID>
85 - <immetingen:namespace>SIKB</immetingen:namespace>
86 - <immetingen:lokaalID>808ef96a-1323-45f8-bab1-afde379884d5</immetingen:lokaalID>
87 - </immetingen:NEN3610ID>
88 - </immetingen:identification>
89 - <immetingen:firstName>Ini</immetingen:firstName>
90 - <immetingen:gender>urn:imsikb0101:geslacht:id:1</immetingen:gender>
91 - <immetingen:lastName>Tials</immetingen:lastName>
92 - <immetingen:middleName/>
93 - <immetingen:initials>I</immetingen:initials>
94 - </immetingen:Person>
95 - </imsikb0101:featureMember>
96 - <!-- /Subject 1-->
97 - <!-- Subject 2 -->
98 - <imsikb0101:featureMember>
99 - <immetingen:Organization gml:id="_4ca84d18-be8b-48f6-8fff-a9073da8db27">
100 - <immetingen:email>info@example.com</immetingen:email>
101 - <immetingen:fax>+31 (0) 88 11111111</immetingen:fax>
102 - <immetingen:identification>
103 - <immetingen:NEN3610ID>
104 - <immetingen:namespace>SIKB</immetingen:namespace>
105 - <immetingen:lokaalID>4ca84d18-be8b-48f6-8fff-a9073da8db27</immetingen:lokaalID>
106 - </immetingen:NEN3610ID>
107 - </immetingen:identification>
108 - <immetingen:mobileNumber>+31 (0)6 123456543</immetingen:mobileNumber>
109 - <immetingen:remarks>Remarks about the Laboratory</immetingen:remarks>
110 - <immetingen:telephoneNumber>+31 (0) 88 callthelab</immetingen:telephoneNumber>
111 - <immetingen:legalentityNumber>092347850</immetingen:legalentityNumber>
112 - <immetingen:name>Laboratory name</immetingen:name>
113 - <immetingen:organisationType>urn:imsikb0101:Betrokkenen:id:29</immetingen:organisationType>
114 - </immetingen:Organization>
115 - </imsikb0101:featureMember>
116 - <!-- /Subject 2 -->
117 - <!-- Sample 1 Analysis Sample -->
118 - <imsikb0101:featureMember>
119 - <imsikb0101:Sample gml:id="_b1adf8f7-e0cd-4810-a93e-60580f34b3fa">
120 - <sam:sampledFeature/>
121 - <sam:relatedObservation xlink:href="#_850d533c-4087-4229-aa81-f916569428ed"/>
122 - <!-- Sub sample 1 / Field sample-->
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347 -

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